Pesquisas acadêmicas e documentos nacionais e internacionais destacam a preocupação com o ensino em conservação da biodiversidade e com o cenário de elevada extinção de espécies. Considerando a perspectiva dialógico-problematizadora do material didático Probio Educação Ambiental (Probio-EA), este constitui-se um potencial complemento à rotina da sala de aula, baseada em livros didáticos incompletos quanto à temática ambiental. Este trabalho propôs-se a fazer a avaliação da contribuição do Probio-EA para a aprendizagem do conceito central extinção de espécies, por meio do uso de conceitos relacionados apresentados segundo conflitos socioambientais e ações positivas. A avaliação foi desenvolvida em salas de aula de 6ª série/7º ano de duas escolas da rede pública de Brasília. Mapas conceituais (MC) foram elaborados em momentos pré-teste e pós-teste, e entre eles, utilizou-se o Probio-EA. Os MC foram contrastados com mapas elaborados por experts, de forma a apresentar resultados acerca da compreensão do conceito central. O material didático associado ao contexto do ambiente escolar mostrou que os alunos constroem mapas conceituais mais semelhantes aos dos experts. Observou-se contribuição positiva do Probio-EA ao arcabouço dos alunos, que passaram a construir mais relações corretas acerca do conceito de extinção de espécies, limitado no contexto escolar. Como o material segue teorias-guia que propiciam o conhecimento da realidade e o conteúdo escolar trabalhado com os alunos não tem ênfase em Extinção de espécies, a aproximação do conhecimento do aluno ao do professor permite inferir que o Probio-EA contribui para a compreensão dos conceitos e processos associados às práticas humanas que levam a extinção de espécies. Assim, o material pode ser agregado a sala de aula com benefícios claros aos alunos e ao professor.