Para facilitar o processo de ensino aprendizagem dos conteúdos curriculares da disciplina de biologia foi realizada uma entrevista pelos 54 estudantes de três séries do ensino médio, sobre o conhecimento etnobotânico de plantas medicinais da comunidade de Pescaria Brava, SC. Essa entrevista proporcionou ambiente investigativo e integração entre as turmas do ensino médio, demonstrou ser uma forma de motivar a aprendizagem dos conteúdos programáticos de biologia. Podendo ainda servir de material motivador para discussões críticas sobre a educação ambiental de forma transversal, envolvendo a investigação de conceitos da etnobotânica de plantas medicinais e farmacognosia. As turmas do ensino médio da escola supracitada, após algumas questões problematizadoras iniciais para discussão de conhecimentos prévios sobre plantas, aplicaram a entrevista sobre o conhecimento da etnobotânica de plantas medicinais, com a comunidade de Pescaria Brava- SC. Com os dados da entrevista os alunos fizeram investigações por série. Cada turma elegeu uma espécie para servir de objeto de investigação. Após a eleição, foram lançados questionamentos por série, relacionadas com os conteúdos curriculares. As primeiras séries, buscaram a relação entre as respostas obtidas no questionário feito com a comunidade e os conteúdos de bioquímica. Foram feitas investigações sobre os princípios ativos dessas plantas, que se relacionam com compostos orgânicos e inorgânicos abordados nesta etapa do ensino médio. As turmas das segundas séries, investigaram a classificação taxonômica dos exemplares eleitos, assim como a importância de conhecer a biodiversidade para a preservação ambiental. As turmas das terceiras séries investigaram as origens dos exemplares escolhidos e motivados por essa investigação produziram um glossário com conceitos estudados em ecologia. Com os resultados da aplicação dessa pesquisa, produziu-se um guia temático para apoio ao ensino investigativo de educação ambiental transversal ao ensino médio.