A população do Sul da Bahia cresceu em meio à necessidade de renda financeira para subsistência, após a queda da lavoura Cacaueira, principal fonte de renda desta região. Assim, grande parte da população só conhecia esta monocultura e práticas agrícolas ancestrais, com o único intuito de obter o sustento, sem preocupações ambientais. A consequência desse modelo de produção foi a redução significativa do Bioma Mata Atlântica, principalmente pela inclusão da pecuária. Nesse contexto, a abordagem biorregionalista e a Educação Ambiental Crítica assumem relevância no processo de abertura de novas formas de se relacionar com o meio natural. Portanto, o objetivo foi desenvolver sequências didáticas investigativas para a transversalização da Educação Ambiental no ensino de Ecologia durante o Ensino Médio, adequadas ao contexto socioambiental do Sul da Bahia. Para subsidiar esse processo, foram realizados os seguintes estudos: (1) Investigação das representações sociais de alunos do 3º ano do Ensino Médio de uma escola pública do Sul da Bahia, sobre o Bioma Mata Atlântica, utilizando a técnica de evocações livres e análise de conteúdo; e (2) Análise do conhecimento dos alunos sobre o Bioma Mata Atlântica por meio da aplicação de um questionário semiestruturado. Os dados descritos evidenciaram lacunas quanto à compreensão sobre o Bioma Mata Atlântica e a Cabruca, o que serviu para elaboração e posterior validação de uma sequência didática investigativa, que busca a (re)significação das representações destes alunos sobre a temática ambiental e sobre o Bioma Mata Atlântica, com foco especial na realidade socioambiental da Região Sul Bahia.