A Educação Ambiental (EA) é um tema recorrente nos discursos políticos, sociais, empresariais e pedagógicos. Com o passar do tempo se tornou uma problemática muito relevante para a sociedade haja vista os impactos negativos provenientes dos problemas ambientais. A escola nesse ínterim, por ser espaço de educação formal que abarca uma grande massa de pessoas, torna-se fundamental na disseminação de práticas sustentáveis e na construção de valores e competências que são fundamentais para diminuir os impactos no meio ambiente. Considerando essa importante função social da escola, faz-se necessário refletir acerca da operacionalidade da EA no seu projeto político pedagógico através do trabalho realizado pelos professores junto aos alunos. Nesse sentido, esta pesquisa busca analisar a abordagem interdisciplinar dos professores da área de Ciências da Natureza no ensino de Educação Ambiental na 3ª série do Ensino Médio utilizando como proposta metodológica as Ilhas Interdisciplinares de Racionalidade (IIR) propostas por Gerard Fourez. As problemáticas do Rio Arabê, um importante curso d'água do município de São Benedito, onde os alunos residem, foram o ponto de partida para uma intervenção pedagógica por meio da IIR junto aos alunos e professores de Ciências da Natureza. A metodologia da pesquisa é do tipo qualitativa através da pesquisa-ação. Como instrumentos de coletas de dados utilizou-se os questionários com perguntas abertas e fechadas para professores e alunos, diário de campo reflexivo, análise documental e a observação participante no intuito de conhecer as concepções prévias acerca da interdisciplinaridade e meio ambiente, registrar o percurso formativo dos alunos assim como avaliar a proposta metodológica de trabalho das IIR. A partir dos dados, pôde-se confirmar que o objetivo de alcançar uma prática interdisciplinar em EA foi cumprido. Observou-se que houve substancial ampliação dos conhecimentos dos alunos acerca dos problemas ambientais do rio e o desenvolvimento do olhar crítico sobre o meio ambiente em geral somado ao desenvolvimento de uma consciência ambiental mais madura. Para os professores colaboradores possibilitou perceber o elo entre disciplinas da área em que atuam e de outras afins ampliando o entendimento acerca da interdisciplinaridade nos seus aspectos metodológicos. Além disso, os conhecimentos adquiridos por meio da IIR culminaram na construção de um guia didático-metodológico de como trabalhar EA interdisciplinarmente.