A relação homem-natureza é um fato recorrente no cotidiano social, de forma direta ou indireta, produzindo saberes populares em relação a interação da vida. Tais conhecimento vêm sendo estudados pela Etnobiologia, sendo a Etnozoologia uma de suas ramificações. O Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Mato Grosso Campus Juína tem como característica ser um campus inserido em uma área ambiental ainda preservada, podendo-se observar diariamente a riqueza da biodiversidade local. Assim, este trabalho teve como objetivo o levantamento de saberes de estudantes e moradores do entorno da escola em relação à fauna, no intuito de promover a integração ao saber científico do ensino de ciências, respaldando-se na Teoria da Complexidade de Edgar Morin e nos Temas Geradores de Paulo Freire. Houve a participação de 88 estudantes do primeiro ano do curso Técnico em Agropecuária e 44 moradores vizinhos à Instituição, sendo que a coleta dos dados realizou-se através de conversas informais gravadas, seguindo um roteiro de questionamentos sobre o conhecimento e a interação com a fauna local. O conjuntos dos moradores citou 101 etnoespécies, enquanto 144 foram citadas pelos estudantes. Interações alimentares, afetivas, zooterápicas e fóbicas foram relatadas. Conclui-se que o conhecimento do ambiente local pode ser uma ferramenta importante para trabalhar a Educação Ambiental e Ciências no IFMT-Juína.