Iniciativas endógenas de desenvolvimento territorial sustentável, tendo como eixo estratégico a agroecologia, vêm sendo desenvolvidas por dois grupos institucionalizados de agricultores familiares nos municípios de Paulo Lopes e Garopaba, em Santa Catarina. Esses grupos possuem articulações entre si e com outros espaços locais e regionais, em sinergia, promovendo a troca de experiências pessoais e profissionais. Formam redes de relações sociais, técnicas e culturais, vindo a constituir o que se denomina sistema local de conhecimento agroecológico. Processos de desenvolvimento territorial normalmente não se desencadeiam espontaneamente, necessitando estratégias plurais de intervenção que, a par das características biofísicas, levem em consideração os aspectos socioculturais locais e as iniciativas endógenas existentes. Ao estudar essas iniciativas é possível avaliar as perspectivas e oportunidades de serem potencializadas mediante ações estratégicas múltiplas. O objetivo proposto por esta pesquisa, de caráter qualitativo, foi de avaliar o papel dos sistemas locais de conhecimento agroecológico nos municípios de Paulo Lopes e Garopaba, como um espaço a ser potencializado no processo de construção de um novo estilo de desenvolvimento territorial sustentável. Concluiu-se que esse é um campo privilegiado para ações educativas dirigidas a potencializar a capacidade e habilidade dos atores que integram o sistema de conhecimento, em especial os agricultores familiares. Estas ações, fundamentadas em concepções pedagógicas inovadoras, visam ampliar as experiências agroecológicas, em escala local e regional, em consonância com o aumento da participação cidadã, de maneira qualificada e pró-ativa, nos espaços de gestão participativa, fortalecendo assim a autonomia das populações locais e contribuindo na construção de um desenvolvimento territorial sustentável.